L'ultima disponibile è una beta, ma a me non ha mai creato problemi.
Non credo che EAC converta tra formati, ma è una feature che non ho mai provato.
Non l'ho fatto perchè, che io sappia, è assolutamente sconveniente (dal punto di vista della qualità audio) fare conversioni tra formati lossy come mp3, ogg, mpc, ecc. (l'unica conversione che faccio è dal file wav ad un formato compresso, quando mi serve).
Dopo tutto non c'è gran bisogno di convertire file, se hai un player come foobar2000 o winamp (quest'ultimo va però fornito dei plugin opportuni). Se invece il tuo problema deriva dall'uso di un lettore mp3 portatile, allora ti conviene scaricare e rippare sempre in mp3 e cercare di convertire il meno possibile.